在生物药物发现实验室中,整个工作流程都是基于目标的,所有最初的努力都集中在识别和理解与疾病相关的目标上。但是,目标发现超出了疾病相关性的基础研究,它同样必须回答有关结构信息以及与其他蛋白质相互作用的所有问题。信号级联。Bruker的生物物理方法组合为您提供了广泛的正交方法,以尽可能广泛地研究感兴趣的目标。所有这些信息都可以在随后的开发阶段进行更理性的基础和药物发现过程。
关键的第一步是评估目标的临床相关性,即对目标的调节是否导致临床期望的结果。在这个阶段很重要in vivo使用转基因和疾病模型的研究通常使用工具化合物来确定靶标的潜力。使用布鲁克的临床前成像系统,例如Biospec MRIandSkyscan Ctcan provide precise events during the disease that may be pertinent to the particular target of interest. Additional information and reduction of total number of animals is gained by longitudinal imaging evaluation ofin vivobiomarker in the fully functioning organ/tissue over a period of time.
疾病状态(例如上调和/或下调)的蛋白质组学表征可以通过timstof Pro系列。高速(高达100 Hz)和由于PASEF引起的灵敏度(Parellel积累串行片段化)方法提供了对蛋白质组学对蛋白质组的最深刻见解。
Target discovery goes beyond basic research of the disease relevance, it equally has to answer all questions regarding structural information and the interaction with other proteins in e.g. signaling cascades. Bruker’s portfolio of biophysical methods offers you a broad range of orthogonal methods to investigate the target of interest as extensively as possible.
X射线衍射是用于确定数百kDa的高分子重量的结构测定的金标准方法。该技术充其量可以对蛋白质的结构和结合行为进行深入了解。由于访问对同步元通常受到严重限制,因此布鲁克(Bruker)提供D8 VENTURE提供最先进的SC XRD机器,具有内部晶体结构确定或晶体筛选的自动化能力。
溶液中的蛋白质可以通过NMR进行结构研究。较小的蛋白质,甚至具有高度柔韧性或本质上无序的蛋白质,同样可用于NMR分析,并具有较高的和ultra-high field NMR。此外,NMR允许研究溶液中通常在生理条件下的蛋白质结构和动力学,并了解包括亲和力在内的配体的结合。下一代高分辨率固态NMR技术(快速MAS,,,,DNP) eventually pioneer the path to structure determination of targets like membrane proteins in their solid state.
交联质谱(XL-MS)和氢氘交换质谱法(HDX-MS)提供补充解决方案,以解决目标结构阐明目标的问题。XL-MS技术通过识别与某些侧链有选择性反应(通常往往赖氨酸和氨基末端)的氨基酸,对蛋白质内和蛋白质之间的分子内和分子内相互作用提供了极大的见解,提供了有关蛋白质的哪些部分与蛋白质相互作用的信息其他部分或其他蛋白质。HDX-MS提供有关蛋白质哪些部分可访问的信息。HDX-MScan also be used to determine epitope/paratope, or ligand binding site using so-called “footprinting” experiments.
表面等离子体共振(spr) adds pivotal information to the target discovery process (Link). The label-free and real-time analysis of an interaction between a biomolecular target and a potential binder (analyte) offers insight into the interaction beyond affinities. Kinetic rate constants allow to understand the temporal stability of a target-analyte complex. Simultaneously, SPR is able to analyze a specific interaction at variable conditions like different pH or co-factors. In addition, SPR can elucidate the binding mechanism of analytes to a protein (e.g. allosteric binding). This way SPR allows to understand the biological context of a target protein more precisely and in real-time. Offering an orthogonal approach toNMR,SPR是一种常用的技术,用于具有已建立的粘合剂或片段的目标验证。