非目标生物标志物发现

非目标生物标志物发现

用于非目标生物标记物发现和分类的MALDI成像

分子变化起源于细胞水平,基于溶液的技术对捕捉小细胞群体产生的变化缺乏敏感性。

样本队列和SCIL的MALDI成像™ 实验室分析软件蛋白质、脂类的空间格局或代谢物将其与样本病理学相关联,以识别和绘制假定的生物标记离子.

乳腺癌活检的图像和分割分析。(l到r)删除未染色的光学图像;4个最上面部分的平均剖面光谱;PCA分析显示前四个部分的分布;基于分子图谱相似性显示前四个片段空间分布的分割图。

使用分子图谱和样本元数据分析大样本队列中的生物标记物发现,以找到与组织学相关的生物标记物。SCiLS™ Lab是领先的生物标志物发现软件,用于通过2D和3D可视化分析质谱成像,以及只需点击几下鼠标即可完成复杂的统计分析,包括:自动空间分割、共定位分析、分类模型计算、ROC和成分分析(PCA、pLSA等)。

基于SCiLS的三维可视化™ 实验室,Oetjen等人,《蛋白质组学杂志》,2013年
五组连续大鼠脑切片的分割分析


布鲁克氏SCiLS™ 实验室分析软件可以使用各种统计工具挖掘数十万个像素。

生物标记物发现协议可以适应新鲜冷冻或福尔马林固定和石蜡包埋(FFPE)组织或组织微阵列(TMA)。许多组织库定期固定生物标本,以便长期保存。固定剂的作用是将蛋白质交联成不溶性网络,从而创造出一种极好的保存技术。FFPE协议涉及抗原回收和蛋白质消化的附加处理步骤。许多出版物已经证明了从组织或释放的N-连接聚糖成像胰蛋白酶肽的实用性。

听说Bruker的MALDI成像工具用于生物标志物发现帮助南卡罗来纳医药大学教授Richard Drake,为癌症发展的糖基化途径提供新的见解。

用于MALDI引导的SpatialOMx的timsTOF fleX

MALDI引导的SpatialOMx®

当您的研究需要在最高的空间背景下提供最深的分子内容时,MALDI引导SpatialOMx®提供高清晰度、无标签概述,将化学信息与重要的形态学背景相结合。点击下面的链接,了解革命性的timsTOF fleX如何将您的发现视角扩展到蛋白质组学、脂质组学、糖组学和代谢组学。

通过MALDI成像增加实验室输出

Bruker Daltonics IntelliSlides现在支持一个全新的工作流,该工作流允许使用FlexMaging 6.0和COMPASS for flex 2.1快速、简单、高度自动化地设置图像采集。

使用TissueScout扫描条形码IntelliSlides,可以在flexImaging中快速识别正确的样本图像,并通过仪器光学对准样本。新的工作流程包括确认仪器性能的检查,以及使用全组织切片和组织微阵列(TMAs)专用算法自动分配测量区域。
使用Bruker-Daltonics可以简化MALDI成像。

有关IntelliSlides和flexImaging 6.0提高效率的更多信息,请参见视频: