几个关键步骤对于确定确定与动态代谢过程相关的化合物是重要的;包括样品制备、数据采集和数据评估。只有控制了所有这些工作流程步骤,才能在生物环境中获得有意义的见解。为了简化和协调这些,布鲁克与李亮教授和他在加拿大阿尔伯塔大学的团队合作,开发了霸王龙®LC-QTOF解决方案。
关键的第一步一道代谢组学是一种可重复的样品制备。因此,作为代谢组学溶液的一部分,提供了制备典型临床研究样本(包括尿液和血浆)的标准操作程序(sop)。
在非靶向代谢组学工作流程中,使用T-ReX进行样品制备,获得高质量的LC-MS/MS数据®LC-QTOF解决方案,无需LC-MS/MS参数优化。分析需要高保留时间稳定性的大样本队列洗提UHPLC和专用的霸王龙一起®洗脱代谢组学试剂盒:RP。反相LC色谱柱工具包使保留时间匹配的值Bruker HMDB代谢物库2.0.的影响二世MS/MS数据采集使用优化的参数,其稳健的性能是高质量数据采集的基础,使复杂样本的广泛分析研究成为可能。
接下来的数据采集,MetaboScape®软件提供了简化的数据评估,能够自动和自信地识别相关已知化合物:
“我们很高兴能与Bruker合作,产生全面的霸王龙®LC-QTOF解决方案.完整的开箱式解决方案为相关的已知内源性代谢物的高可信度鉴定提供了基础,并能够通过通路映射将其纳入生物环境中。这种解决方案将为研究人员在尿液或血浆等典型研究样本的非靶向代谢组学方面提供领先优势。”
磁共振质谱(MRMS)的表型
通过UHPLC-QTOF-MS / MS分析,通过UHPLC-QTOF-MS / MS分析使得在表型中的综合组合物中的复杂混合物进行复杂混合物的深层代谢谱。通常不同的LC方法和正极离子模式中的不同LC方法和数据采集,以成本为单位;分析每个样本所需的时间。
磁共振质谱(MRMS)极端分辨率使得能够通过省略耗时的色谱法通过省略耗时的色谱来加速样品吞吐量和发现代谢组科研究。流动注射分析(FIA)或基于MALDI的工作流程提供LC-MS分析不容易检测的化合物,并同时分析已知和未知的代谢物。
对于高通量需求,正如在表型组学研究中通常遇到的那样,UHPLC-QTOF-MS/MS分析由MRMS aXelerate补充,这是一种无lc MRMS工作流解决方案,它检测并生成每个样品的> 1000个中高水平代谢物的分子公式,并揭示许多在LC-MS中未见的额外代谢物,包括极性化合物。由FIA或MALDI进行MRMS分析可为复杂样品(如尿液和血浆提取物)提供高样品通量。霸王龙强大的数据提取能力®二维的MetaboScape®提供自动注释的可信度。这是通过质量精度<0.2 ppm和质量分辨率可以超过>1百万,从而提高同位素精细结构保真度实现的。
在最近的出版物中学习FIA-CASI-MRMS工作流程如何通过与人类代谢数据库匹配的匹配和IFS模式的增加来解决Quias-CASI-MRMS工作流程,以便将“暗代谢物质”的匹配增加2.6倍。一种增强的同位素细结构方法,用于发现代谢组织的精确批量分析:FIA-CASI-FTMS
“MRMS极端分辨率使我们能够解决下一代代谢物,即对动态生物/化学过程的数百名已知和数千个新代谢物的同时迅速描述。MRMS与Metaboscape相结合,还将使其他研究人员能够在探索“暗代谢物的新的和令人兴奋的研究领域”。
仅供研究使用。不用于临床诊断程序。