代谢组学解决方案

T-Rex®LC-QTOF溶液

因为每个步骤都很重要...

简化的T-Rex®LC-QTOF代谢组学溶液

几个关键步骤对于自信地识别与动态代谢过程相关的化合物很重要。包括样本准备,数据采集和数据评估。只有在控制所有这些工作流程步骤时,才能在生物环境中获得有意义的见解。为了简化和协调这些,Bruker与Liang Li教授及其在加拿大艾伯塔大学的团队合作开发了T-Rex®LC-QTOF解决方案。

…“ T-Rex®LC-QTOF解决方案”包括为研究人员提供无针对性代谢组学的局面的所有内容

第一个关键步骤非靶向代谢组学是可再现的样品制备。因此,作为该代谢组学解决方案的一部分,提供了用于制备典型临床研究样品(包括尿液和血浆)的标准操作程序(SOP)。

高质量LC-MS/MS数据的获取遵循非目标代谢组学工作流程的样品制备,T-Rex®LC-QTOF解决方案,不需要LC-MS/MS参数优化。为了分析需要高保留时间稳定性的大型样本队列洗脱UHPLC与专用的T-Rex结合®提供Enute代谢组学:提供RP。相反的相位LC列套件可以将保留时间与值匹配Bruker HMDB代谢物图书馆2.0。这影响II对于MS/MS数据采集,使用优化的参数,其稳健性能是高质量数据采集的基础,从而可以对复杂样本进行广泛的分析研究。

遵循数据采集,代谢®软件提供简化的数据评估,从而可以自动且自信地识别相关已知化合物:

  • 独特的T-Rex®3D特征提取技术是随后代谢物识别和统计数据评估的关键。通过自动执行参数自由保留时间对齐和区域的完整提取,提取所有相关信息以实现自信的代谢物识别,同时降低了统计分析中的假阴性率。
  • Bruker HMDB代谢物图书馆2.0作为该代谢组学溶液的一部分,为> 800代谢产物提供了MS/MS光谱,并提供> 600个相关代谢物的保留时间信息。图书馆是对相关标记的自信识别的先决条件。
  • 内利科在布鲁克生成MS/MS Spectrametabobase®个人图书馆3.0实现暂定识别相关目标,这些目标尚未作为纯参考标准可用。
  • 注释质量(AQ)评分提供了快速概述,使每个注释参数有信心。
  • 途径映射功能可以将已识别化合物的设置设置为生物环境。

“我们很高兴与布鲁克合作制作了全面的T-Rex®LC-QTOF解决方案。包装盒的完整解决方案为相关已知的内源性代谢物的高置信度提供了基础,并使它们能够使用途径映射将其设置为生物环境。该解决方案将为研究人员提供针对尿液或等离子体等典型研究样本的非靶向代谢组学的局限性。”

加拿大艾伯塔大学化学教授Liang Li博士

MRMS轴向

磁共振质谱法(MRMS)的表型

UHPLC-QTOF-MS/MS分析启用了在表型背景下发现代谢组学的复杂混合物的深度代谢分析。通常,以阳性和负离子模式的方式将不同的LC方法和数据采集合并为成本;每个样本所需的时间。
磁共振质谱法(MRMS)极端分辨率通过省略耗时色谱法,可以加速现象学和发现代谢组学研究中样品吞吐量。流量注射分析(FIA)或基于MALDI的工作流程提供了对LC-MS分析不容易检测到的化合物的访问,并同时分析已知和未知代谢物。
对于现象学研究中通常遇到的高通量需求,UHPLC-QTOF-MS/MS分析是由MRMS Axelerate补充的,MRMS Axelerate是一种无LC的MRMS工作流程溶液,可检测和生成> 1,000个中高级分子的分子配方,每个样品> 1,000中等水平的代谢物。并揭示了LC-MS中未见的许多额外代谢产物,包括极性化合物。FIA或MALDI的MRMS分析为复杂样品的表型(例如尿液和血浆提取物)提供了高样品吞吐量。T-Rex强大的数据提取®2d in代谢®对自动注释有信心。这是通过质量精度<0.2 ppm和质量分辨率来实现的,质量分辨率可以超过100万,从而增强了同位素精细结构保真度。

在最新出版物中了解FIA-CASI-MRMS工作流程如何通过与人类代谢数据库匹配的2.6倍增加2.6倍来解决“黑暗代谢问题”的追求,并增加了IFS模式:一种增强的同位素精细结构方法,用于发现代谢组学中精确质量分析:FIA-Casi-FTMS

“ MRM的极端分辨率使我们能够解决下一代代谢,即同时快速描述与动态生物/化学过程相关的数百种已知和数千种新代谢物。MRMS与代谢结合在一起还将使其他研究人员能够阐明这个新的令人兴奋的研究领域,以探索“深色代谢组”。

德国HelmholtzZentrumMünchen的分析生物地球化学的Philippe Schmitt-Kopplin教授

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仅用于研究。不用于临床诊断程序。