Proteoforms

自底向上的猎枪蛋白质组学极其敏感,允许研究人员深入挖掘蛋白质组学。然而,重要的生物学信息,如选择性剪接或内源性蛋白质水解的影响仍然是一个重大的挑战。

分析完整Proteoforms

通过分析完整的变形来解锁另一个维度

直接分析未消化的蛋白质形态可以克服许多限制,并构成一个非常强大的生物标志物候选发现工具。Bruker的uhr - qtof具有处理非常复杂的完整蛋白质混合物的能力,没有分辨率损失,准确性或动态范围,这使它们特别适合这项任务。

为临床研究提供自上而下的发现
自顶向下的蛋白质组学中完整蛋白质的复杂混合物对许多质谱仪来说是一个重大挑战。这已经在一定程度上克服了在质谱分析之前广泛使用的预分馏。尽管预分馏有效,但在比较大样本队列时,它会导致再现性问题。Bruker公司的UHR-QTOF系统可以从复杂的变形异构体混合物中提供高度重现性和准确的信息,并且需要较少的样本预分离,从而提高了再现性,并使其与临床研究所需的大样本队列相兼容。

生成的标签自由火山图,从蛋白质图谱研究显示定量结果。

处理完整的蛋白质混合物

Bruker公司的UHR-QTOF系统结合了全灵敏度分辨率和真同位素模式(TIP™),用于精确测量复杂混合物中的完整蛋白质。强大的Dissect™和SNAP™算法提取准确的质量和强度信息,用于对完整蛋白质的直接无标签分析。所有Bruker QTOF仪器提供四极杆

CID片段谱非常适合于识别低到中等分子量的蛋白质形态,而maXis II的额外ETD片段能力可以从大型蛋白质形态生成丰富的序列信息。

变形分析解决方案

Bruker的蛋白质图谱解决方案包括自动化整个过程的方法,从校准、提取和输出测量的完整蛋白质特征,到通过统计分析识别受调控的蛋白质组。然后,可以使用该信息创建一个预定的前体片段列表,以启用相应变形的有效片段,从而识别它们。

Dissect™处理分离20分钟梯度脑脊液提取恢复超过120 coelution峰,对应超过800种不同的变形。
5.2分钟后解卷积完整的蛋白质谱。使用SNAP™计算单同位素质量,该™考虑了实验确定的非常精确的同位素模式(真同位素模式)。