蛋白质组

自下而上的鸟枪式蛋白质组学非常敏感,允许研究人员深入挖掘蛋白质组。然而,重要的生物信息,如选择性剪接或内源性蛋白质水解的影响仍然是一个重大挑战。

完整蛋白质组的分析

通过分析完整的蛋白质形式解锁另一个维度

直接对未消化的蛋白质组进行分析可以克服许多局限性,是发现候选生物标记物的一个非常强大的工具。Bruker的UHR QTOF能够处理完整蛋白质的非常复杂的混合物,而不存在分辨率损失、准确性或动态范围,因此特别适合于这项任务。

为临床研究实现自上而下的发现
自上而下蛋白质组学中完整蛋白质的复杂混合物对许多质谱仪来说是一个重大挑战。通过在MS分析之前使用广泛的预分馏,这在一定程度上得到了克服。尽管预分馏有效,但在比较大样本队列时会导致再现性问题。Bruker的UHR-QTOF系统从复杂的蛋白质组混合物中提供高度可重复和准确的信息,并且需要较少的样品预分馏,从而提高再现性,并使其与临床研究所需的大样本队列兼容。

从显示定量结果的蛋白质分析研究中生成的无标签火山图。

处理完整的蛋白质混合物

Bruker的UHR-QTOF系统将全灵敏度分辨率与真实同位素模式(TIP)相结合™) 用于复杂混合物中完整蛋白质的精确测量。强大的解剖功能™ 折断™ 算法提取准确的质量和强度信息,以便对完整蛋白质进行直接无标记分析。所有Bruker QTOF仪器都提供四极

CID片段谱非常适合于低至中等分子量蛋白质组的鉴定,而maXis II额外的ETD片段能力甚至可以从大型蛋白质组生成丰富的序列信息。

蛋白质组分析解决方案

Bruker的蛋白质组分析解决方案包括从校准、提取和输出测量完整蛋白质特征到通过统计分析识别受调控蛋白质组的整个过程自动化的方法。然后,该信息可用于创建预定的前体片段列表,以实现相应蛋白质组的有效片段化,从而识别它们。

解剖™ 用20分钟梯度分离的脑脊液提取物处理可恢复120多个共溶峰,对应800多个不同的蛋白质组。
5.2分钟后,解卷积完整蛋白质光谱。使用SNAP计算单同位素质量™ 这将实验确定的非常精确的同位素模式(真正的同位素模式)考虑在内。