代谢®
より多くバイオマーカーを见つける
より强い自信持って
ハイライト
MetaBoscape®でよりのををを
特長
データ取得から生物学的洞察へ
代谢® は、ブルカーのESI & MALDIイメージング装置からのノンターゲットな分析データを処理するため、統一されたワークフローによりステップ数を簡素化し、バイオマーカーを迅速にピンポイントで特定することができます。
metaboscape®はディスカバリーボロミクス，リピドミクス，，ミクス，，制薬などなどののアプリケーションアプリケーション分野分野またがってて使用するすることができことができ，基本的的なな同定同定同定作业からから高度な统计统计统计に提供し。
- 代谢® の強力なT-ReX®アルゴリズムは、堅牢なデータ処理を確実にするために、保持時間アライメント、デアイソトープ、ピーク抽出から構成されています。
- ユーザー定義のAnalyte Listを使用して、ターゲット化合物を自動的にアノテーションすることができます。
- 未知化同定をにするためライブとととIn silicoフラグメンテーション
- pca t-t检验，方差vls pls pls，，などのな统计を使用して，复雑なデータセット内内内のの
- データ品质のとなるなるなるつのつのアノテーションアノテーション品质品质（スコアリングスコアリングスコアリングスコアリングスコアリング
- 特定さ代谢物生物学に位置し，を知识に変换するパスウェイマッピング
- ローカルで予测をた薬物・代谢物同定同定同定
- 大規模サンプルコホートにおけるサンプル効果を相殺するためのバッチ補正
- 时系列でのの経时変化解析
- 4d-kmdプロットプロットアノテーションプロットプロットプロットプロット，，，，をををリピドミクス専用アノテーション
- 既知合物同定をにするため，MetaboBASE Personal Library、HMDB Metabolite Library、Bruker Sumner MetaboBASE Plant Library（130以上の化合物のCCS値を含む）、およびカスタムライブラリをサポート
- GNPS(Global Natural Products Social Molecular Networking)でのインポートに適したファイル形式へのカスタマイズされたデータエクスポート
- 迅速な，のユーザーによるメソッドデータセットセット有有有を可能にするクライアント
- 代谢® のセミターゲットワークフローは、tasqを使用した絶対定量のためのターゲットワークフローと連携していますす
利点
プラットフォーム間での単一ワークフロー
ノンターゲットプロファイリングの目的は、特定の生理学的状態やサンプルに特徴的な物質を同定することです。すべての化合物のダイナミックな時間的・空間的フィンガープリントへのアクセスを可能にする単一のワークフローは存在せず、補完的なプラットフォームからのデータを評価する必要があります。MetaboScape® は、ESIとMALDIイメージングの両方からの補完的なデータの評価を可能にすることで、これらのニーズに対応し、生物学的に関連するマーカーを自信を持って割り当てることができます。
未知化合物の同定は、プリカーサーとフラグメントの正確な質量情報に基づいた分子式決定（SmartFormula3D）、ローカルおよびパブリックデータベースの検索（CompoundCrawler）、予測と実測MS/MSのマッチングを行うIn silicoフラグメンテーション（MetFrag）、化学的に関連する化合物を同定するためのMS/MSバケットマッチングなど、統合されたツールによってサポートされます。
未知化合物の同定パイプライン
A) SmartFormula3Dは、精密質量、同位体パターン、プリカーサーイオン情報を自動的にマッチングさせることで、プリカーサー分子式の候補を通常1つまたは数個に特定します。
b）ローカルベース公开ベースから式検索し，可能性のある构造构造の候补ますますます
c）metfrag机能を使用たたIn silicoフラグメンテーションにより、理論的なフラグメント構造と測定されたMS/MSピークを照合し、可能性の高い構造をスコア表示します。
D) オプションのMS/MSバケットマッチングにより、類似したMS/MSスペクトルを持つ化合物を割り当てて、未知の構造的に類似している可能性の高い化合物を同定することができます。
薬物代謝物を同定するためのファーマワークフロー
薬物代謝物の同定は、製薬研究にとって大きな関心事であるだけでなく、メタボロミクス、フェノミクス、エキスポソミクス、ノンターゲットスクリーニングにおいても関心が高まっています。そこでは、薬物や殺虫剤、毒素、麻薬などの外来物質の代謝物が発生することが予想され、いわゆるダークメタボロームと呼ばれる未同定化合物のファミリーに属する可能性があります。
代谢® は、液体サンプルからのみならず、SpatialOMxワークフローを使用して組織直接からでも、これらの代謝産物の割り当てるローカルBioTransformer1ベースの代謝産物予測をサポートしています。さらに、統合された時系列プロットを使用して、これらの代謝物の時間変化を追跡し、半定量することができます。
([1] Djoumbou-Feunang et al.; Journal of Cheminformatics 2019, 11:2).
完全に统合れたたたたたフローフロー
MetaBoscape®のベースのアノテーション，，，，，，，，，，，，，，，のののを考虑脂种种のの同定同定同定をを可能ににししますます。。脂质脂质（LC）（LC）自动同定简素化し。。
metaboscape®，kendrick质量缺陷（kmd）ををし可视化，，，複雑な質量スペクトル情報を，脂质の相同反復単位(例：CH2)に基づいたクラスタリングを含む組成マップに変換します。カスタマイズ可能な4D-KMDプロットにより、直観的な脂質ID検証が可能です。抽出されたピークの様々な特性を4次元（x軸、y軸、カラースケール、バブルサイズ）でプロットすることができ、汎用性の高いアプリケーションが可能です。
- 保持時間 対 m/zをプロットすることで、脂质クラスごとに异なる色を使用して脂質クラスの分离しますこのカラー使用する，同じ脂质クラスクラスのアノテーションを保持保持时间の顺顺ににに。
- m/z 対 CCSをプロットすることで、鎖の長さや二重結合数の違いがある脂質で観察されたCCSの傾向を視覚化し、脂質データをさらに詳しく調べることができます。これらの傾向は、脂質のクラスIDを確認するために使用することができ、未知数のアノテーションを支援し、偽陽性を除去するのにます。
- 繰り返し単位としてCH2Kendrick质量缺陷をたをを可视で，したクラスクラスのの脂脂脂质种の饱和度饱和度や锁长锁长の整合ををを迅速迅速迅速にに调べる调べることができことができます。またまたまたまたまたまたまたまたまた，，，，，，，，，例で，で予想予想されるやや，，や，つのつの相补的的な次元次元ををすべてすべてたたたたたたたたたたた
アプリケーション
4dオミックス可能にするするre t-rex®4D
メタボロミクスおよびリピドミクス分析の主な要件は、異常や疾患の結果として変化する化合物を迅速にピンポイントで特定することです。保持時間、プリカーサー質量、同位体パターン、MS/MS スペクトルのマッチングは、化合物アノテーションの信頼性を高めるための一般的な基準です。timstof propasefははははは秒间数のの百百百百百データデータ收集しし，，，，，，回回回回回ののの分析でよりよりより高い高い高いフラグメントフラグメントカバーカバーカバーカバー率率率ををを実现実现実现しします，，，，，，，，，，，，，，，，，，苍蝇“ fly”モビリティー使用てよりなななななななスペクトルスペクトルを。。。。。。。。。。。。。。。値値値値はは面积面积面积面积（CCS）値値値値値补完れなる信頼を提供し。。
MALDIイメージングのためのT-ReX²とT-ReX³
SCiLS Labソフトウェアとの連携により、T-ReX²はSpatialOMxベースのノンターゲットプロファイリングを強化し、薬物代謝物、脂質、糖鎖などのピーク抽出とアノテーションを可能にします。T-ReX³はCCSアノテーションも組み合わせ、timsTOF fleXのMALDIイメージングにより取得したデータを空間的にマッピングし、信頼性の高いアノテーションを可能にします。
T-ReX® 2D - FIA-MRMS ‘MetaboTyping’
クロマトグラフィー非使用のmrm aXelerateワークフローは、フェノミクス研究において時間のかかるクロマトグラフィーを省略することで、より高いサンプルスループットを提供します。LC-MS分析では容易に検出できない化合物にアクセスできるため、ターゲットおよびノンターゲットメタボロミクスアプローチが可能になります。MetaboScape® のT-ReX® 2Dによるデータ抽出は、FIA MRMSデータの自動アノテーションに信頼性をもたらします。新開発のscimaX MRMSシステムは、100万以上の質量分解能と0.2ppm以下の質量精度を持つ極めて優れた性能を発揮します。この超高分解能により、Isotopic Fine Structureを利用した明確な組成解析が可能となり、ノンターゲットメタボロミクスにおける化合物同定に別次元の信頼性がもたらされます。
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お客様の声
“ aqコンセプト，断面积で补完されましたた。によりにより，，，，，，，“
“分子プロファイリング、構造解明、イメージングにおける高度かつ多様なフェノタイピング課題に対して、新しいMRMSシステムの性能は私たちの期待以上のものでした。非常にユーザーフレンドリーで、すべてのラボが持つべきです。"
“代谢® のクライアント・サーバー設定は、多くのユーザーにメタボロミクスデータへのインタラクティブなアクセスを容易に提供できるため、中核設備として理想的です。"
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