Metaboscape.^®

Metaboscape.^®使用统一的工作流程来处理Bruker的ESI和MALDI成像仪器的非针对性分析，简化步骤数和快速定位和识别生物标志物。

Metaboscape.^®可以跨应用领域使用，包括发现代谢组，脂素，表情，食谱，环境和制药，并为用户提供灵活地支持从基本ID到高级统计数据的工作流程。

• Metaboscape.^®强大的T-ReX算法包括保留时间对齐、去同位素和特征提取，以确保稳健的数据处理
• 目标化合物可以使用用户定义的分析物列表自动注释
• 未知的ID管道，包括图书馆匹配和在Silico.碎片，以方便未知的身份证
• 使用受监督和非监督统计数据可视化复杂数据集中的相关信息，包括PCA，T检验，ANOVA，PLS和桶相关分析
• 注释质量（AQ）评分提供五个数据质量指标
• 在生物学背景下将识别的代谢物设置为设置的途径映射，从而将数据转化为知识
• 利用局部代谢物预测识别药物和外源代谢物
• 批量校正在大型样本队列中偏移采样效果
• 时间序列曲线调查代谢物随时间的变化
• 专用的脂素注释工具，包括基于规则的注释，4D kendrick大规模缺陷绘图和CCSPREDICT
• 简化了已知的识别，元标记^®支持MetaboBASE个人库、HMDB代谢物库、Bruker-Sumner MetaboBASE植物库（包括>130种化合物的CCS值）以及自定义库
• 自定义数据导出到适合导入的文件格式国民生产总值（全球天然产品社会分子网络）
• 客户端 - 服务器架构，可启用快速数据处理和多个用户共享方法和访问共享数据集
• MetaboScape中的半目标工作流^®与目标工作流齐头并进，使用TASQ.^®

非目标分析的目的是识别特定生理状态或样本的特征。由于没有单一的工作流程来访问所有化合物的动态时间和空间指纹，因此需要评估补充平台的数据。MetaboScape^®通过允许评估来自ESI和MALDI成像的互补数据，并在其生物学背景下自信地分配相关标记来解决这些需求。

通过综合工具支持未知化合物的鉴定，例如基于精确的前体和碎片（Smartformula3D）的分子式测定，搜索本地和公共数据库（ExpanceCrawler），在Silico.碎片化以匹配测量的MS / MS（Metfrag）和MS / MS桶匹配以鉴定化学相关化合物。

未知ID管道：
A） SmartFormula3D通过自动匹配精确的质量和同位素模式片段和前体离子信息，将可能的前体分子公式限制为通常一个或几个候选分子。
b）在本地和公共数据库中查询候选公式，返回可能的结构候选人。
（C）在Silico.使用实施的METFRAG功能的碎片化与理论片段结构与测量的MS / MS峰值和得分最有可能的结构相匹配。
d）可选的MS / MS铲斗匹配使得能够分配具有类似MS / MS光谱的化合物，以识别进一步可能未知但可能的结构相似的化合物。

药物代谢物的鉴定不仅是药学研究的重要内容，而且在代谢组学、表型组学、暴露组学和非靶点筛选工作流程中也得到了越来越多的关注。在这里，预计会出现药物或其他外源性物质（如杀虫剂、毒物或麻醉剂）的代谢物，这些代谢物可能属于未知的所谓暗代谢组化合物家族。

Metaboscape.^®支持本地生物变压器^1.基于代谢物预测，用于将这些代谢产物分配，这些代谢产物均由液体样品和使用Spatialomx工作流程直接从组织进行。另外，可以通过使用集成时间序列图跟踪和半量化这些代谢物的时间变化。

^{（[1]Djoumbou-Feunang等人，《化学信息学杂志》，2019年，11:2）。}

基于规则的元标记的注释例程^®考虑到脂质体标准倡议（LSI）指导方针，可以鉴定脂质物种。这种Lipid类（LC）注释工具避免了过度注释的这种风险，并简化了脂质特征的自动识别。

Metaboscape.^®可以计算和可视化Kendrick大规模缺陷，转动复杂质谱信息进入A.构图和点的信息聚类基于脂质特异性同源重复单位（如CH_2.). 可定制的4D Kendrick质量缺陷图允许直观的脂质ID验证。提取的特征的各种特征可以在4维（x轴、y轴、色阶和气泡大小）中绘制，允许多种应用。

• 绘图保留时间vs m / z揭示了这一点分离不同的脂质课程使用不同颜色为了不同的脂肪类.使用此颜色编码，您可以轻松地在保留时间或CCS中偏离的注释，相对于其余的脂肪类。
• 绘图m / z vs ccs，您可以通过可视化对脂质观察到的CCS的趋势来进一步询问脂质数据，其中链长和双键数的差异。这些趋势可用于确认脂肪类ID和可以助攻在里面注释未知数并帮助删除误报.
  
• 用ch可视化kendrick质量缺陷_2.指定为重复单元允许快速研究所选阶级的脂质物种以进行饱和和链长一致性。另外，作为三酰基甘油（TGS）注释的脂质所显示的例子揭示了使用反相色谱的预期洗脱序列，以及CCS值的增加趋势，充分利用了所有4个互补尺寸。
  

代谢组和脂质族菌分析的主要要求是快速定位并鉴定因扰动或疾病而改变的那些化合物。匹配保留时间，前体质量，同位素图案和MS / MS光谱是用于在化合物注释中访问置信度的常见标准。pasef.^®计算机上的数据采集timstof pro每秒提供数百个MS / MS事件，导致单一分析中的碎片bob综合客户端app覆盖深度更深。此外，pasef.^®光谱从离子迁移率分离中受益，因此使用禁用的迁移率滤波器获得更清洁的MS / MS光谱。每个MS值都与碰撞截面（CCS）值互补，以衡量分析物的形状，为ID提供进一步的置信度。

结合SCiLS™ 实验室软件，T-Rex²赋予了基于Spatialomx的非目标分析，用于处理和注释特征，包括药物代谢物，脂质和聚糖。首次，使用这种独特的T-Rex³的独特组合来映射分析物，并将其与化合物的CCS感知注释相结合，以实现使用MALDI成像在TIMSTOF Flex系统上获得的化合物的更高置信化合物。

色谱法是免费的MRMS Axelerate Workflow.通过省略现象研究中的耗时色谱来提供更高的样品吞吐量。通过LC-MS分析可以易于检测化合物，允许靶向和非靶向的代谢组种方法。T-REX 2D在Metaboscape®中的数据提取为FIA MRMS数据的自动注释提供了置信度。新型SCIMAX MRMS系统可以显示出极端性能，质量分辨率> 100万和<0.2ppm的质量准确性。超高分辨率使您能够利用同位素精细结构，以实现元素组成的明确测定。这为非靶向代谢组学中的复合ID增加了另一种置信层。