Metaboscape.^®

Metaboscape.^®使用统一的工作流程来处理Bruker的ESI和MALDI成像仪器的非针对性分析，简化步骤数和快速定位和识别生物标志物。

Metaboscape.^®可用于多个应用领域，包括发现代谢组学、脂质组学、表型组学、食物组学、环境和制药，并为用户提供灵活性，以支持从基本ID到高级统计的工作流程。

• Metaboscape.^®强大的T-rex算法包括保留时间对齐，解剖和特征提取，以确保稳健的数据处理
• 目标化合物可以使用用户定义的分析物列表自动注释
• 未知的ID管道，包括图书馆匹配和在网上碎片，以方便未知的身份证
• 使用监督和非监督统计数据可视化复杂数据集中的相关信息，包括PCA, t检验，方差分析，PLS和桶相关分析
• 注释质量（AQ）评分提供五个数据质量指标
• 在生物学背景下将识别的代谢物设置为设置的途径映射，从而将数据转化为知识
• 用局部代谢物预测鉴定药物和异叶代谢物
• 批量校正在大型样本队列中偏移采样效果
• 时间序列曲线调查代谢物随时间的变化
• 专用的脂素注释工具，包括基于规则的注释，4D kendrick大规模缺陷绘图和CCSPREDICT
• 为了简化已知的识别，MetaboScape^®支持这一点Metabobase个人图书馆，HMDB代谢物库，Bruker Sumner metabobase植物库（包括> 130种化合物的CCS值）以及定制库
• 自定义数据导出到适合导入的文件格式GNPS.(全球天然产品社会分子网络)
• 客户端-服务器架构，支持快速数据处理和多个用户共享方法和访问共享数据集
• Metaboscape的半针对性工作流^®使用目标工作流量携手流动，以绝对量化使用TASQ^®

非靶向分析的目的是识别特定生理状态或样品的特征的特征。由于没有单个工作流程来实现所有化合物的动态时间和空间指纹，需要评估来自互补平台的数据。Metaboscape.^®通过允许评估来自ESI和MALDI成像的互补数据，并在其生物学背景下自信地分配相关标记来解决这些需求。

通过综合工具，如基于准确质量的前体和片段的分子式测定(SmartFormula3D)，本地和公共数据库的搜索(CompoundCrawler)，在网上碎片化以匹配测量的MS / MS（Metfrag）和MS / MS桶匹配以鉴定化学相关化合物。

未知的ID管道:
a）Smartformula3D通过自动匹配精确的质量和同位素模式片段和前体离子信息，将可能的前体分子型成体限制为通常一个或多个候选物。
b）在本地和公共数据库中查询候选公式，返回可能的结构候选人。
C）在网上使用实现的MetFrag功能的碎片将理论碎片结构与测量的MS/MS峰值和最可能的结构得分相匹配。
d）可选的MS / MS铲斗匹配使得能够分配具有类似MS / MS光谱的化合物，以识别进一步可能未知但可能的结构相似的化合物。

药物代谢物的鉴定不仅对药物研究的兴趣感兴趣，而且越来越受到代谢组科，表情，提示学和非目标筛查工作流程的兴趣。在此，预期发生药物或其他异丙酸的代谢物，如杀虫剂，毒品或毒品，这可能属于未识别的所谓的暗代谢化合物。

Metaboscape.^®支持本地Biotransformer.¹基于代谢物预测，用于将这些代谢产物分配，这些代谢产物均由液体样品和使用Spatialomx工作流程直接从组织进行。另外，可以通过使用集成时间序列图跟踪和半量化这些代谢物的时间变化。

^{（[1] Djoumbou-Feunang等.; CheminFormatics 2019，11：2）。}

MetaboScape中基于规则的注释例程^®根据脂质组学标准倡议(LSI)的指导方针，使脂质物种的识别成为可能。这种脂类(LC)注释工具避免了过度注释的风险，简化了脂类特征的自动识别。

Metaboscape.^®可以计算和可视化Kendrick大规模缺陷，转动复质谱信息进入A.组成地图和积分信息集群基于脂质特异性同源重复单元（例如CH₂的）．可定制的4D kendrick质量缺陷图允许直观的脂质ID验证。提取特征的各种特性可以绘制在4尺寸（X轴，Y轴，颜色刻度和泡沫尺寸）中，允许多功能应用。

• 绘图保留时间vs m/z揭示了分离不同的脂质课程使用不同的颜色为了不同的脂质类．使用这种颜色编码，您可以很容易地发现与相同脂类的其他脂类相比，在保留时间或CCS上有明显偏差的注释。
• 绘图m / z vs CCS，你可以通过观察不同链长和双键数的脂质在CCS中的变化趋势来进一步询问脂质数据。这些趋势可以用来确认脂类id协助在注释的未知数和帮助去除假阳性．
  
• 用ch可视化kendrick质量缺陷₂指定为重复单位，允许快速调查脂类的饱和和链长一致性选定的类。此外，所示的被标注为三酰基甘油(TGs)的脂类的例子揭示了使用反相色谱法的预期洗脱顺序，以及充分利用所有四个互补维度的CCS值的增加趋势。
  

代谢组学和脂质组学分析的主要要求是快速查明和识别那些由于干扰或疾病而发生变化的化合物。匹配保留时间、前体质量、同位素模式和MS/MS谱是评价复合注释可信度的常用标准。PASEF^®数据采集timsTOF职业每秒提供数百个MS / MS事件，导致单一分析中的碎片bob综合客户端app覆盖深度更深。此外，pasef.^®光谱从离子迁移率分离中受益，因此使用禁用的迁移率滤波器获得更清洁的MS / MS光谱。每个MS值都与碰撞截面（CCS）值互补，以衡量分析物的形状，为ID提供进一步的置信度。

和这个结合SCILS™实验室软件，T-Rex²赋予了基于Spatialomx的非目标分析，用于处理和注释特征，包括药物代谢物，脂质和聚糖。首次，使用这种独特的T-Rex³的独特组合来映射分析物，并将其与化合物的CCS感知注释相结合，以实现使用MALDI成像在TIMSTOF Flex系统上获得的化合物的更高置信化合物。

色谱自由MRMS Axelerate Workflow.通过在表型研究中省去耗时的色谱，提供更高的样品吞吐量。化合物是易于获得的，不易检测的LC-MS分析，允许靶向和非靶向代谢组学方法。MetaboScape®中的T-ReX 2D数据提取为FIA MRMS数据的自动注释提供了信心。新型scimaX MRMS系统的质量分辨率达到>1百万，质量精度<0.2 ppm。超高分辨率使您能够利用同位素精细结构，明确确定元素组成。这为化合物ID在非靶向代谢组学中的应用增加了一层信心。