4 d-proteomics™

在timsTOF Pro和timsTOF fleX中增加离子迁移率尺寸带来的好处比灵敏度、选择性和MS/MS采集速度的提高更多。独特的tims设计允许重复测量所有检测离子的碰撞截面(CCS)值，这些可以进一步提高系统的选择性，从复杂样品和短梯度分析中获得更多可靠的相对定量信息。

DIA是用于解决价值缺失问题的最广泛的收购策略。然而，使用它需要构建光谱库——当涉及到不常见的生物体时，这可能是及时的和困难的——而传统的DIA方法太慢，无法与短梯度分析兼容。在这种情况下，PASEF-LFQ提供了速度、灵活性和可靠性。尽管如此，即使使用> 100Hz MS/MS，在每次分析中，一些肽段可能不会被选择进行碎片化，特别是在使用短梯度时。

已经开发了运行之间的匹配(MBR)方法来解决这个缺失值的问题。MBR利用窄的m/z和保留时间窗口提取所有肽的强度信息进行量化。这种过滤器组合，以前认为不够具体，导致不准确的比率测量。4D-MBR为第一个m/z和保留时间添加了一个额外的CCS过滤器，允许更大的特异性，如我们的应用说明所示151年质．

DIA与PASEF的结合^®允许补偿传统的DIA缺陷:通过在连续的tims事件中使用m/z隔离窗口模式，在DIA - pasef中使用的离子百分比bob综合客户端app^®可以大大增加(对于低复杂度的样本，可以达到100%，对于高复杂度的样本，使用相似的隔离窗口大小和m:z范围，仍然比传统的DIA方法高5倍)。的dia-PASEF^®循环时间可以减少，使它兼容短梯度分离，同时保持高选择性。它得益于timspace浓度效应，允许增加灵敏度，并将DIA选择性提高到下一个水平，完全4d蛋白质组学™支持。

dia-PASEF^®现在可以使用OpenSwath & MOBI-DIK或Biognosys的Spectronaut软件来处理数据。通过阅读我们的应用笔记了解更多157年质和160年质．