NMR和EPR Pharma Solutions

铅发现和优化

NMR-powered solutions with a wealth of structural information at physiological conditions

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库定义
图书馆筛选
结构生物学
铅优化

概述

Complete workflow from fragment library quality check, cocktail design and automated hit identification to quantitative assessment of binding (Kd) and the 3D analysis of ligands.

库定义

图书馆筛选

  • 用筛选样品处理样品jet
  • 标准和可定制1H and19F NMR筛选实验可以自动化
  • 高的1H and19F对冷冻探针的敏感性(QCIF
  • 自动化1H and19F与FBS与Mnova屏幕的集成在一起的命中检测

结构生物学

mnova结合自动处理蛋白质配体滴定2D HSQC,跟踪峰运动并计算KD的多个峰。

铅优化

溶液中游离配体采用的3D构象会影响对药物靶标的结合亲和力。它们的结构分析有助于加快潜在客户优化。
Mnova Stereofitter使用实验性NMR约束(QNOE,化学位移和J耦合)生成3D构象种群。

Особенности

特征

  • 自动获取1H and19f nmr Iconnmr实验。默认实验可以在布鲁克库中找到:
    -1H NMR screening experiments with buffer/water suppression:1h 1d,饱和转移差,
    沃特林,
    -T2和T1rho
    -19F筛选实验与解耦。
  • 基于Topspin片段的筛选功能桥梁通过分析获取。在获取后,数据会自动分析mnova屏幕。结果以功率点状格式在Mnova屏幕中报告。
  • 蛋白质观察的筛选使用化学移动扰动(CSP)方法。然后,在使用数据进行分析之前,先执行靶标的H-C相关实验(HSQC),并使用增加的配体量mnova结合,,,,which enables vizualisation of the data and the determination of Kd.
  • Mnova Stereofitter根据各种形式的NMR实验数据输入,计算3D结构配置和/或构象的概率。当前,Stereofitter可以接受四种不同类型的输入,以计算最佳的3D结构候选者:NOES,RDC,JS和化学移位。
  • The workflows can be enriched with aMnova DB,例如,为了存储片段筛选实验中经常使用的片段的筛选数据和1D光谱。

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好处

  • NMR对碎片结合的敏感性理想地匹配了预期片段的弱亲和力范围(离解常数KD在微摩尔[μm]的范围内与几毫米[mm])
  • NMR筛选实验提供结合和配体/S结构信息
  • NMR is unique in determining experimentally the ligand’s conformation in solution (3D analysis), unravelling the conformational change between solution and bound state
  • 选择性和广泛的分散固有19f nmr,使19f筛选有吸引力的方法
    - 它可以在混合物中容纳多达30个片段
    - 由于T2效应强,高灵敏度
    - 选择性:蛋白质样品中没有荧光
    -19商用F片段库。
  • 鉴于典型的筛选可以生成数百个频谱,因此自动化和健壮的数据分析软件可以通过最小的手动操作和出色的可重复性来铅发现和优化。
  • All requesite software tools are now included in the new Lead discovery and Optimization Suite. Contact us for more information!

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