超分辨率显微镜

DNA-PAINT成像

单分子局部化显微镜在纳米形貌中的点积累

探索DNA-PAINT解决方案

用于多路复用、多色DNA-PAINT成像的唯一现成解决方案

结合了布鲁克的软件控制,自动化,完全集成微流体装置这个Vutara VXL超分辨率显微镜唯一的商业系统这提供了开箱即用的多路DNA-PAINT功能。在这些工具上进行DNA-PAINT成像可以在单分子定位显微镜中实现低于10 nm的定位精度具有无限的复用潜力.

此外,带有微流控系统的Vutara显微镜还具有以下优点:

  • 通过专家服务和支持轻松设置,加快数据收集速度bob电竞官方网站
  • 结果比通过改装系统收集的数据更可靠和可重复
  • 自动化和多条件/多用户编程,易于扩展的实验设计

了解更多有关DNA-PAINT解决方案的信息

联系我们,了解有关使用Vutara VXL显微镜执行DNA-PAINT实验的更多信息。

什么是DNA-PAINT?

什么是DNA-PAINT?

DNA-PAINT是一种通过将荧光团标记的短(<10个核苷酸)寡核苷酸与结合到靶分子(通常为抗体)的互补寡核苷酸结合来实现单分子定位的技术。它允许广泛的成像模式,从全细胞广泛的Z-堆栈到高分辨率多目标图像。

了解DNA-PAINT成像的优势

短寡聚体的结合在本质上是短暂的,因此产生了类似于dSTORM或PALM的眨眼效果,然而DNA-PAINT与其他眨眼技术相比具有许多优势。对核酸纳米结构使用DNA-PAINT成像的优点包括:
  • 更高的光子产量:闪烁的持续时间通常比传统的dSTORM长。这导致荧光团产生更高的光子,因此与dSTORM和PALM等方法相比,可以获得更高的定位精度(<10 nm)。
  • 几乎不可漂白的成像:样品浸泡在过量的荧光团中,允许极长时间的成像。
  • 无限复用潜力:由于靶点特异性是由核苷酸序列决定的,因此有了正确的工具,就有可能用不同的寡核苷酸序列标记多个靶点。使用Vutara的集成微流体装置,可以从样本中清洗给定目标的成像链,并可以添加标记不同生物目标的不同成像链。

DNA-PAINT是如何工作的?

DNA-PAINT是如何工作的?

DNA-PAINT的工作原理是将含有荧光团的短“成像寡核苷酸”瞬时结合到目标上的互补寡核苷酸(称为“对接链”),如抗体、纳米体、适配子或自杀酶配体。

使用DNA-PAINT的超分辨率显微镜

DNA-PAINT超分辨率成像涉及几个步骤,包括:

  1. 样本通过常规技术标记为“对接链”,并准备成像。
  2. 对于成像,将样品浸泡在成像缓冲液(通常为PBS,但可包括氧清除剂)和与对接链互补的低浓度(通常为0.1-1 nM)成像低聚物中。成像寡核苷酸的长度通常为9-10个核苷酸,并含有荧光团。我们推荐Cy3B用于DNA-PAINT,因为它具有荧光性,因此背景较低。
  3. 一旦进入成像缓冲区,就可以对样本进行成像。成像链与对接链的瞬时结合阻止荧光团的扩散,使其能够在相机上成像。

由于样品浸泡在大量过量的不断交换的成像链中,因此目标基本上是不可漂白的,这使得批量处理大量帧和扩展的Z堆栈成为可能。

上图展示了DNA-PAINT的工作原理。靶蛋白(微管蛋白)用标记有对接链低聚物的抗体标记。然后将样品浸泡在成像链低聚物中。荧光标记的成像链与对接链的瞬时结合导致样本出现闪烁,然后可在Vutara SRX软件中定位。重复此过程,直到形成超分辨率图像。

为什么要使用DNA-PAINT?

为什么要使用DNA-PAINT进行3D细胞超分辨率成像?

BS-C-1细胞微管蛋白网络的三维细胞骨骼成像。细胞标记α -微管蛋白一级抗体和抗兔低聚偶联二级抗体。左:由深度着色的三维微管蛋白网络。右:微管蛋白聚合物的特写,显示空心标记腔。二级dna油漆抗体购自Massive-Photonics.com

高精度定位

DNA-PAINT允许低于10纳米的定位精度,使其成为最精确的显微镜技术之一。

在这里,使用了一个水浸1.2 NA物镜的Vutara显微镜进行DNA-PAINT实验。这张图片显示了一个完整的BS-C-1细胞的微管蛋白网络,该网络用微管蛋白抗体标记,该抗体与DNA-PAINT二级抗体结合。插图显示微管蛋白网络的放大部分。微管管腔清晰可见。

多色不褪色成像

使用DNA-PAINT可以实现多路多色超分辨率成像。

DNA-PAINT具有大规模多色Z-堆叠的潜力,这是因为样品浸泡在几乎无限量的荧光团中。这使得由数百万次定位组成的大规模z叠成像成为可能。

在这里,在Vutara单分子定位显微镜上进行了双色DNA-PAINT实验。微管蛋白用青色标记,网格蛋白用品红标记。此外,由于DNA-PAINT的不可漂白性质,大Z-堆叠是可能的。

BS-C-1细胞中微管蛋白网络和网格蛋白笼的3D细胞骨架成像。用α-微管蛋白和抗网格蛋白重链一级抗体以及抗兔和抗鼠寡聚物结合二级抗体标记细胞。上图:用α-微管蛋白(青色)和网格蛋白笼(洋红)标记的BS-C-1细胞。底部:与上面相同图像的电影,显示数据的3D性质。二级DNA-PAINT抗体从Massive-Photonics.com购买
左:DNA-PAINT的工作流程。每个靶点(肌动蛋白、tom20、微管蛋白和网格蛋白)都标记有一级和二级抗体。二级抗体具有正交对接链。在流入下一个目标的下一个成像链之前,通过在互补成像寡聚物中流动到所需目标,然后进行清洗步骤,依次对每个目标成像。流体和成像由Vutara显微镜和SRX软件自动处理。右:来自每个目标的图像在SRX软件中自动组合。二级DNA-PAINT抗体从Massive-Photonics.com购买

无限复用潜力

DNA-PAINT在多路成像方面具有巨大的潜力。

在这里,使用Vutara VXL和集成射流装置进行了多靶DNA-PAINT实验。在不同的探针上使用正交的对接链,可能有无限数量的目标。

图中还显示了在Vutara单分子定位显微镜和集成射流装置上进行的四靶DNA-PAINT实验。肌动蛋白洋红、tom20青色、微管蛋白黄和网格蛋白绿。

样本图像

使用带射流的Vutara VXL自动采集的图像

样本图像:用于改进超分辨率成像的DNA涂料

BS-C-1标记有抗微管蛋白、肌动蛋白、抗tom20和抗网格蛋白。正交2ºDNA-PAINT抗体购自Massive-Photonics.com.

左上:肌动蛋白品红色,微管蛋白黄色,线粒体橙色。


右上:线粒体青色,肌动蛋白洋红,微管蛋白黄色,网格蛋白重链绿色。
左下:F-肌动蛋白-青色,网格蛋白笼绿色。
右下:线粒体青色,微管蛋白品红色。