Run & Done with PaSER

不是2022

PaSER 2022是一个GPU驱动的实时数据库搜索平台,为自底向上的蛋白质组学提供并行计算能力和实时数据库搜索结果。

直接结果!

实时结果=效率

不是

Destaques

PaSER是效率和节约

实时结果通知您当前的仪器和样品状态

分析时间
数据库搜索需要时间,只要收购完成,就可以用不受影响的搜索结果消除这一步。
仪器的时间
要确保每一分钟都很重要,使用PaSER你可以确保你的乐器时间是用最有意义的方式度过的。
珍贵的样本
保存那些珍贵的样本!无论它们是单细胞的,临床的,SILAC或丰富的PaSER的智能将确保它们不会被不必要的浪费。
成本
仪器时间、试剂和样品制备都很昂贵。PaSER和Run & Done将节省资金,因为你确信你正在生成有意义的数据。

Caracteristicas

不是2022

4d -蛋白质组学™,具有实时搜索结果和智能采集

整合PaSER提供的实时数据库搜索和智能采集,突破数据分析瓶颈

普遍可用的

  • 所有当前和未来的timsTOF Pro和fleX平台都可以通过PaSER访问

4 d-proteomics™

  • ccs感知的数据是丰富的,即便如此,实时数据库搜索功能是PaSER的现实,包括PTMs,如磷酸化

GPU能力下的大规模并行化

  • PaSER是GPU驱动的,在数千个CUDA核上提供巨大的计算能力

不是数据回顾

  • 从高水平的实验信息到感兴趣的特定片段离子光谱,从所有PaSER盒上的集成查看器中查看您的数据的复杂细节
智慧
  • PaSER是智能的,在样品采集的最后,用户定义的蛋白质或多肽的资格决定了样品队列的进程,这检查适用性,节省宝贵的样品,昂贵的消耗品和仪器时间

锻炼耐力

不是2022

节省时间和成本

  • 不用再担心注射那些珍贵的样本了。
  • 不用再担心浪费仪器时间。
  • 不用再担心那些有昂贵的试剂和样品准备的样品,只注射在一个性能差的系统。
  • 不再等待QC运行以确定系统的适用性。
  • 在方法开发期间不再等待搜索结果。

Aplicacoes

不是2022

完整的数据库搜索在少于5毫秒

惊人的搜索速度和不妥协的搜索结果。

A)复制人体细胞裂解液DDA的蛋白ID,使用PaSER获得实时结果,并对MaxQuant进行基准测试

B)肽ID从复制的DDA运行的人类细胞裂解液使用PaSER实时结果和基准MaxQuant

C) PaSER和MaxQuant鉴定97%的相同蛋白质和近90%的相同肽。

PaSER提供了从实时搜索中获得的一致结果,与离线搜索相同的数据。由于数据库搜索算法是在GPU上运行的,与基于CPU的搜索相比,搜索时间可以忽略不计。

除了实时搜索,搜索更大空间的具体应用,包括PTM研究的机会成为现实。

看看你一直错过了什么

由TIMS Viz驱动的MOMA viewer提供了前所未有的强大功能来查看4d蛋白质组学数据。从四极杆和TOF上游的迁移分离和聚焦导致了等压和近等压物种的分离。使用其他技术,在PTM富集和复杂样品分析的情况下,共洗脱物种是等压或近等压质量共碎片是常见的。timsTOF Pro/fleX通过首先通过碰撞截面分离离子来消除这一问题。对此类事件进行可视化、搜索和排序的功能以前从未有过。bob综合客户端app我们将具有不同迁移率值的等压质量称为迁移偏移质量对齐(MOMA),而TIMS Viz可以在复杂运行中梳理出此类事件。bob综合客户端appTIMS Viz允许您设置公差,以您的自由裁量,同时覆盖两个功能和psm,观察后数据库搜索。TIMS Viz可以让你看到你以前不知道的东西。

在线研讨会

视频

Testemunhos

“在我们的timsTOF Pro上,PaSER盒子提供的实时结果已经节省了大量的时间。这使我们能够开发实时的方法,告知LC和仪器性能,总体上大大提高了效率。”

Sebastian Vaca,麻省理工学院和哈佛大学布罗德研究所(卡尔实验室)蛋白质组学平台研究科学家,剑桥,美国

“创新的软件工具是用质谱技术解决悬而未决的生物问题的必要条件。timsTOF Pro的捕获离子迁移功能和健壮性提供了独特的自底向上的蛋白质组学功能,可以有效地用于研究许多疾病。”

约翰·耶茨三世教授,加州拉霍亚斯克里普斯研究所欧内斯特·w·哈恩教授

但是informacoes